La Oficina de Representación del Órgano Interno de Control en la Secretaría de Ciencias, Humanidades, Tecnología e Innovación, es una unidad que tiene como finalidad el prevenir, detectar, sancionar y erradicar las prácticas corruptas en el Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California (CICESE), asimismo, promueve la transparencia y el apego a la legalidad de los servidores públicos, mediante la realización de auditorías y revisiones a los diferentes procesos de la Institución, así como también atender, tramitar y resolver las quejas, denuncias y peticiones ciudadanas presentadas por la ciudadanía contra presuntas irregularidades administrativas cometidas por los servidores públicos, imponiendo las sanciones establecidas en la Ley General de Responsabilidades Administrativas.